BỘ MÁY GIÚP VIỆC TỔNG CỤC TRƯỞNG 
THỰC HIỆN CHỨC NĂNG QUẢN LÝ NHÀ NƯỚC

       1- Cục giám sát, quản lý về Hải Quan
        2- Cục kiểm tra thu thuế Xuất nhập khẩu
        3- Cục điều tra chống buôn lậu
        4- Cục công nghệ thông tin và thống kê Hải Quan
        5- Vụ Tổ chức cán bộ và đào tạo
        6- Vụ kế hoạch và tài vụ
        7- Vụ pháp chế
        8- Vụ quan hệ quốc tế
        9- Thanh tra
        10- Văn phòng

    ĐƠN VỊ SỰ NGHIỆP

        1- Viện nghiên cứu khoa học Hải quan
        2- Trường Cao đẳng Hải quan
        3- Báo Hải quan